Для копирования концевых сносок между документами необходимо выделить и скопировать слово/фразу с индексом или только индекс с привязкой к концевой сноске в тексте. После чего выполнить операцию вставки в другой документ. Копировать текст концевой сноски (после жирной горизонтальной линии) не нужно.
Важно учесть, что индексация в новом документе после вставки, может отличаться от исходной в зависимости от количества концевых сносок в документах.